Der Wiederaufbau folgte im Wesentlichen drei Leitgedanken:

(1) Die Frauenkirche George Bährs sollte unter weitgehender Verwendung historischer Bausubstanz gemäß den historischen Originalplänen wiedererrichtet werden. Das sollte (2) unter Einsatz moderner Technologie und heute gültiger Erkenntnisse der Baustatik und Bauphysik geschehen und (3) berücksichtigen, was für eine lebendige Nutzung im 21. Jahrhundert erforderlich ist.

Durch die weitgehende Verwendung der historischen Bausubstanz wird das Schicksal der Zerstörung auf lange Zeit ablesbar bleiben. Die dunkle Färbung der alten Steine und die Maßdifferenzen in den Anschlussbereichen zwischen neuem und altem Mauerwerk erinnern an die Narben einer geheilten Wunde. So wird die Frauenkirche auch in Zukunft Zeugnis ablegen über die Geschichte ihrer Zerstörung. Zugleich ist sie aber ein Zeugnis der Überwindung von Feindschaft und ein Zeichen der Hoffnung und Versöhnung.